A forma segura de transferir dados de uma instalação do Moodle para outra é via processo de backup e restauração de curso.
Para isso siga os seguintes passos:
1)Faça backup do curso na instalação do Moodle origem. Veja como fazer isso nesse vídeo: http://moodleeduc.badiu.com.br/?p=186
2)Faça restauração do backup do curso na instalação do Moodle destino. Veja como fazer isso nesse vídeo: http://moodleeduc.badiu.com.br/?p=198
Observação:
Esse tipo de transferência de dados não levam os dados do log do usuário gerados no contexto do sistema Moodle. Dados tais como ação de login e logout.
Se tiver uma instalação nova mais atualizada e pretende trazer os dados da instalação antiga, o procedimento é fazer backup e restauração. Uma alternativa é atualizar a instalação antiga para versão mais recente. Assim não precisa de transferir os dados.