A Plataforma Moodle usa serviço SMTP para enviar e-mail. Quando há situações em que alguns alunos recebem e-mail e outros não, as hipóteses mais prováveis são:
a) Limite de envio de e-mail por parte do servidor SMTP
b) Politica de SPAM definido no servidor SMTP receptor / Configuração do servidor emissão para evitar SPAM
Nesse tipo de situação, é preciso analisar o log do servidor STMP cadastrado no Moodle para ver a possível causa do problema.