Anderson,
Neste caso crie uma base de dados centralizado. Pode ser uma base ldap ou mesmo mysql.
Em cada Moodle gerencia login integrado nessa base Moodle já tem plugin para isso. A alteração de senha deve ser para um url dessa base centralizado. Isso pode ser configurado na interface do Moodle. Por outro lado, vai precisar de um cron que fareje alteração e inserção de novos usuários e replique automaticamente em cada uma das instalações.